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Uno de los objetivos de PERIAGUA es contribuir a mejorar las habilidades técnicas de las y los funcionarios de las EPSA para el control de la calidad del agua, que involucra los
procesos de: análisis del agua, control de la cloración, control de la infraestructura, y limpieza y desinfección de los sistemas de agua potable.
El progrma contribuyó a la elaboración de la Política de la Calidad del Agua contribuyó a la elaboración de la Guía de Control de la Calidad del Agua, como parte del material de la Caja de Herramientas de SENASBA para el Fortalecimiento Institucional.